생화학물질

탄수화물은 탄소(C), 수소(H), 산소(O) 원소로 구성된 생화학물질로, 일반적으로 수소와 산소의 원자 비율이 물(H2O)과 같은 2:1을 이루는 경우가 많아 '수화된 탄소'라는 의미의 이름을 갖는다. 이들은 생물체의 주요 에너지원으로 작용하며, 구조적 지지체 역할을 하기도 한다.

탄수화물은 단당류, 이당류, 다당류로 크게 분류된다. 단당류는 글루코스(포도당), 프루토스(과당), 갈락토스처럼 더 이상 가수분해되지 않는 가장 기본적인 단위이다. 이당류는 두 개의 단당류가 결합한 것으로, 설탕으로 알려진 슈크로스(글루코스+프루토스), 젖당(갈락토스+글루코스), 맥아당(글루코스+글루코스) 등이 있다. 다당류는 수백에서 수천 개의 단당류가 긴 사슬을 이루며, 글리코겐(동물의 에너지 저장체), 녹말(식물의 에너지 저장체), 셀룰로스(식물 세포벽의 주요 구성 성분)가 대표적이다.

생물체 내에서 탄수화물의 가장 중요한 기능은 에너지 공급이다. 글루코스는 해당과정과 시트르산 회로를 통해 분해되어 세포가 사용할 수 있는 ATP를 생성한다. 또한, 구조적 탄수화물인 셀룰로스는 식물의 강성을 유지하고, 키틴은 곤충의 외골격과 균류의 세포벽을 구성한다. 세포 표면의 당사슬은 세포 인식과 신호 전달에도 관여한다.

지질은 물에 녹지 않고 유기 용매에 잘 녹는 생체 분자군을 총칭한다. 이들은 에너지 저장, 세포막 구성, 신호 전달 등 생명체의 다양한 기본 기능을 수행한다.

지질은 화학 구조와 기능에 따라 여러 하위 범주로 나뉜다. 대표적인 것으로는 중성지방(트리아실글리세롤), 인지질, 스테로이드, 왁스 등이 있다. 중성지방은 글리세롤에 지방산이 세 개 결합한 구조로, 동식물의 주요 에너지 저장 형태이다. 인지질은 인산기를 포함한 머리 부분과 지방산 꼬리 부분으로 구성되어 있으며, 이들의 특성은 세포막의 기본 골격을 형성하는 데 핵심적이다.

지질의 기능은 매우 다양하다. 중성지방은 고농축 에너지원으로 작용하며, 피하 조직에 축적되어 단열과 보호 기능도 제공한다. 인지질으로 이루어진 세포막은 선택적 투과성을 가져 세포 내외 물질 교환을 조절한다. 스테로이드류인 콜레스테롤은 동물 세포막의 유동성 조절에 관여하며, 스테로이드 호르몬의 전구체가 된다. 또한, 일부 지질은 비타민 흡수나 세포 간 신호 분자로도 작용한다.

지질 대사의 이상은 여러 질환과 연관된다. 혈중 중성지방과 콜레스테롤 수치의 불균형은 동맥경화, 심혈관 질환의 주요 위험 인자로 알려져 있다. 반면, 필수 지방산의 섭취 부족은 건강 문제를 일으킬 수 있어, 지질의 종류와 균형 있는 섭취가 중요시된다.

단백질은 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 고분자 유기 화합물이다. 모든 생명체의 구조와 기능에 핵심적인 역할을 하며, 세포의 주요 구성 성분이다. 단백질은 20가지 표준 아미노산의 다양한 조합과 배열로 구성되며, 이 아미노산 서열은 유전 정보에 의해 결정된다. 단백질의 기능은 그 독특한 3차원 구조에 의해 좌우된다.

단백질의 주요 기능은 매우 다양하다. 구조 단백질은 세포와 조직의 형태를 유지하는 역할을 한다. 효소는 생화학 반응의 촉매로 작용하여 대사를 가능하게 한다. 수송 단백질은 산소나 이온 같은 물질을 운반하며, 항체는 면역 반응을 담당한다. 또한 호르몬과 수용체로서 신호 전달에 관여하기도 한다.

단백질의 구조는 1차부터 4차 구조로 나누어 설명한다. 1차 구조는 아미노산의 선형 배열이다. 이 서열은 수소 결합 등을 통해 알파 나선이나 베타 병풍 같은 규칙적인 2차 구조를 형성한다. 이러한 구조들이 더 접혀서 전체적인 3차 구조를 이루며, 여러 개의 폴리펩타이드 사슬이 모여 복합체를 구성하면 4차 구조가 된다. 구조가 변성되면 기능을 상실한다.

단백질은 식이를 통해 섭취되면 소화 과정에서 아미노산으로 분해된 후, 체내에서 필요에 따라 재합성된다. 단백질의 결핍 또는 구조적 결함은 다양한 질병을 유발할 수 있어, 영양학과 의학 분야에서 중요한 연구 대상이다.

핵산은 생물체의 유전 정보 저장과 전달을 담당하는 필수 생화학물질이다. 핵산은 뉴클레오타이드라는 기본 단위체가 긴 사슬처럼 연결된 고분자로, 그 주된 종류는 DNA와 RNA이다. DNA는 주로 세포핵에 존재하며 생물의 유전 정보를 장기간 보관하는 역할을 한다. 반면 RNA는 DNA의 정보를 바탕으로 단백질 합성을 중개하거나 다양한 생화학적 조절 기능을 수행한다.

핵산의 구조는 그 기능을 이해하는 데 핵심적이다. DNA는 이중 나선 구조를 이루며, 두 가닥의 뉴클레오타이드 사슬이 염기쌍(A-T, G-C)을 통해 서로 결합되어 안정성을 확보한다. 이 구조는 유전 정보의 정확한 복제와 보존을 가능하게 한다. RNA는 일반적으로 단일 가닥 구조를 가지며, DNA보다 불안정하지만 mRNA, tRNA, rRNA 등 다양한 형태로 존재하여 유전 정보의 전사와 번역 과정에서 각기 다른 역할을 맡는다.

핵산의 기능은 유전 정보의 저장과 발현에 국한되지 않는다. 예를 들어, ATP는 에너지 저장과 전달을 위한 핵산 유도체이다. 또한, 일부 RNA 분자는 효소와 같은 촉매 기능을 수행하여 리보자임이라고 불린다. 최근 연구에서는 유전자 발현을 조절하는 miRNA나 siRNA와 같은 작은 RNA 분자들의 중요성이 부각되고 있다.

핵산 연구는 생명과학 전 분야에 걸쳐 근간을 이룬다. 유전체학은 전체 DNA 서열 분석을, 전사체학은 RNA 발현 패턴을 연구한다. 이러한 연구는 질병의 진단, 유전자 치료, 형질전환 작물 개발 등 의학 및 농업 분야에 폭넓게 응용되고 있다.

효소는 생물체 내에서 화학 반응의 속도를 극적으로 증가시키는 생체 촉매이다. 효소의 대부분은 단백질로 이루어져 있으며, 일부는 리보자임과 같이 RNA로 구성되기도 한다. 효소는 반응물에 특이적으로 결합하여 활성화 에너지를 낮춤으로써 반응을 촉진한다. 이 과정에서 효소 자체는 소모되지 않고 재사용된다.

효소는 그 기능에 따라 산화환원효소, 전이효소, 가수분해효소, 분해효소, 이성질화효소, 연결효소 등으로 분류된다. 각 효소는 고유한 기질 특이성을 가지며, 주로 기질의 이름에 'ase'를 붙여 명명한다. 예를 들어, 아밀라아제는 전분을 분해하고, 프로테아제는 단백질을 분해한다.

효소의 활성은 온도, pH, 기질 농도, 효소 농도, 그리고 억제제나 활성제의 존재에 의해 영향을 받는다. 최적 온도와 최적 pH 범위를 벗어나면 효소는 변성되어 그 기능을 상실한다. 또한 많은 효소들은 보조 인자라고 불리는 비단백질성 분자(예: 금속 이온, 조효소)를 필요로 한다.

효소는 소화, 에너지 생산, DNA 복제, 세포 신호 전달 등 생명체의 거의 모든 대사 과정에 관여한다. 의학 및 산업 분야에서도 널리 응용되는데, 진단 키트, 약물 개발, 식품 가공, 세제 제조 등 다양한 곳에서 효소의 특이적 촉매 능력이 활용된다.

비타민과 무기질은 생물체가 정상적인 생리 기능을 유지하고 성장하기 위해 필요하지만, 신체 내에서 충분한 양을 합성하지 못해 식이를 통해 외부에서 섭취해야 하는 필수 영양소이다. 이들은 에너지를 직접 공급하지는 않지만, 탄수화물, 지질, 단백질의 대사를 포함한 수많은 생화학 반응에서 보조 인자나 조효소로 작용하여 신체의 항상성 유지에 핵심적인 역할을 한다.

비타민은 크게 수용성 비타민과 지용성 비타민으로 나뉜다. 수용성 비타민(예: 비타민 B군, 비타민 C)은 체내에 저장되지 않고 쉽게 배출되므로 꾸준히 섭취해야 한다. 이들은 주로 에너지 대사와 관련된 효소 반응의 조효소로 작용한다. 지용성 비타민(예: 비타민 A, D, E, K)은 지방 조직과 간에 저장될 수 있으며, 시각, 골격 건강, 항산화, 혈액 응고 등 다양한 생리적 기능에 관여한다.

무기질은 체중의 약 4~5%를 차지하는 무기 염류로, 칼슘, 인, 칼륨, 나트륨, 마그네슘, 철, 아연 등이 대표적이다. 이들은 체액의 삼투압과 산염기 평형을 조절하고, 신경 자극 전달과 근육 수축에 필수적이며, 뼈와 치아의 주요 구성 성분이 된다. 또한, 철은 헤모글로빈의 구성 성분으로, 아연은 여러 효소의 보조 인자로 작용하는 등 특정 생화학적 기능을 수행한다.

비타민과 무기질은 상호작용하며 작용하는 경우가 많다. 예를 들어, 비타민 D는 칼슘의 장내 흡수를 촉진하고, 비타민 C는 철의 흡수를 증가시킨다. 이들의 결핍은 각종 대사 장애와 결핍증을 유발하며, 과잉 섭취 역시 독성을 나타낼 수 있어 균형 잡힌 섭취가 중요하다.

해당과정은 세포 내에서 포도당 한 분자를 분해하여 피루브산 두 분자, ATP, 그리고 환원된 조효소를 생성하는 일련의 생화학적 반응이다. 이 과정은 세포 호흡의 첫 번째 단계이며, 산소 유무와 관계없이 모든 생물체의 세포질에서 일어난다.

해당과정의 주요 목적은 포도당 분해를 통해 에너지(ATP)를 획득하고, 이후의 대사 경로를 위한 전자 운반체(NADH)와 피루브산을 생성하는 것이다. 총 10단계의 효소 반응으로 구성되어 있으며, 각 단계는 특정 효소에 의해 촉매된다. 과정 초반에는 ATP를 소모하여 포도당을 활성화시키지만, 후반부에서 더 많은 ATP를 순생산한다.

이 과정의 최종 순산물은 피루브산 2분자, 순 2분자의 ATP, 그리고 2분자의 NADH이다. 생성된 피루브산은 세포의 조건에 따라 다르게 처리된다. 산소가 충분한 경우 미토콘드리아로 이동하여 시트르산 회로와 산화적 인산화를 통해 더 많은 ATP를 생성한다. 산소가 부족한 조건(혐기성 조건)에서는 피루브산은 젖산이나 에탄올 등으로 전환되어 NAD+를 재생한다.

해당과정은 에너지 생산의 핵심 경로일 뿐만 아니라, 다양한 중간체가 핵산, 아미노산, 지질 등의 합성 전구체로 제공된다는 점에서 대사 네트워크의 중심 교차로 역할을 한다. 이 과정의 조절은 에너지 수요와 공급, 호르몬 신호에 반응하여 효소의 활성을 통해 정밀하게 이루어진다.

시트르산 회로는 세포의 미토콘드리아 기질에서 일어나는 일련의 효소 반응 순환이다. 이 과정은 해당과정 등에서 생성된 아세틸-CoA를 이산화탄소로 완전히 산화시키며, 이때 방출되는 에너지는 NADH와 FADH2 형태로 저장된다. 시트르산 회로는 산화적 인산화와 직접적으로 연결되어 ATP를 대량으로 생산하는 핵심적인 역할을 한다.

이 회로는 구연산이라고도 불리는 시트르산이 최초 생성물이기 때문에 그 이름이 붙었다. 아세틸-CoA가 옥살아세트산과 결합하여 시트르산을 형성하는 것을 시작으로, 8단계의 연속적인 반응을 통해 다시 옥살아세트산이 재생성되는 순환 구조를 이룬다. 각 단계는 특정 효소에 의해 촉진되며, 중간 생성물들은 다양한 생합성 경로의 전구체로도 사용된다.

시트르산 회로의 가장 중요한 기능은 탄수화물, 지질, 단백질의 최종 산화 경로로서의 역할이다. 이 세 가지 주요 영양소는 모두 대사 과정을 거쳐 최종적으로 아세틸-CoA로 전환되어 이 회로에 진입한다. 따라서 시트르산 회로는 세포 호흡의 중심 허브라 할 수 있으며, 생명체가 음식물로부터 화학 에너지를 추출하는 데 필수적이다.

산화적 인산화는 세포 호흡의 마지막 단계로, 미토콘드리아 내막에서 일어나는 과정이다. 이 과정에서는 전자전달계를 통해 전자가 전달되면서 생성된 에너지가 이용되어, 아데노신 이인산(ADP)에 인산기가 결합해 아데노신 삼인산(ATP)이 대량으로 합성된다. 이는 해당과정과 시트르산 회로에서 생성된 소량의 ATP를 보완하여, 세포가 사용할 수 있는 에너지의 대부분을 공급하는 핵심적인 역할을 한다.

전자전장계는 네 가지 주요 단백질 복합체(I, II, III, IV)와 두 가지 이동체(유비퀴논, 사이토크롬 c)로 구성된다. 해당과정과 시트르산 회로에서 생성된 NADH와 FADH2는 각각 전자전달계의 복합체 I과 복합체 II에 전자를 제공한다. 이 전자들은 복합체 사이를 이동하면서 에너지를 방출하고, 그 에너지는 미토콘드리아 내막을 가로질러 양성자(H+)를 막 사이 공간으로 펌핑하는 데 사용된다.

이렇게 형성된 양성자 농도 기울기(전기화학적 기울기)는 큰 에너지를 저장한다. 미토콘드리아 내막에 위치한 ATP 합성효소는 이 양성자가 농도 기울기를 따라 내막을 통과해 매트릭스로 유입될 때 발생하는 에너지를 이용한다. ATP 합성효소의 회전 운동은 이 에너지를 기계적 에너지로 변환하여, ADP와 무기 인산으로부터 ATP를 합성하는 화학적 반응을 촉진한다. 이 메커니즘을 화학삼투설이라고 부른다.

산화적 인산화는 산소를 최종 전자 수용체로 사용한다. 복합체 IV에서 전자는 분자 상태의 산소(O2)로 전달되어 물(H2O)이 생성된다. 따라서 이 과정은 호기성 조건에서만 효율적으로 진행된다. 만약 산소 공급이 차단되면 전자전달계가 정체되고 양성자 기울기가 형성되지 않아 ATP 합성이 중단되며, 세포는 급격한 에너지 부족에 직면하게 된다.

크로마토그래피는 혼합물을 구성하는 각 성분을 분리하고 정제하는 데 널리 사용되는 실험 기법이다. 이 방법은 이동상과 고정상이라는 두 가지 상 사이에서 각 성분이 서로 다른 분배 계수를 보이는 원리를 이용한다. 이동상은 시료를 운반하는 액체나 기체이며, 고정상은 분리 과정이 일어나는 고체 지지체나 액체 막이다. 시료가 이동상에 의해 고정상을 통과할 때, 각 성분은 고정상과의 상호작용 정도에 따라 다른 속도로 이동하게 되어 분리가 이루어진다.

크로마토그래피는 분리 메커니즘과 사용하는 상의 종류에 따라 여러 가지로 분류된다. 흡착 크로마토그래피는 고정상 표면에 대한 흡착력 차이를, 분배 크로마토그래피는 두 상 사이의 용해도 차이를 이용한다. 이온 교환 크로마토그래피는 이온성 고정상과 시료 이온 사이의 전하 상호작용을, 친화성 크로마토그래피는 생체 분자 간의 특이적 결합(예: 항원-항체)을 활용한다. 또한, 이동상이 액체인지 기체인지에 따라 액체 크로마토그래피와 기체 크로마토그래피로 크게 나눌 수 있다.

생화학 연구에서 크로마토그래피는 단백질, 핵산, 대사 중간체, 약물 등 다양한 생화학물질의 분리와 분석에 필수적이다. 예를 들어, 고성능 액체 크로마토그래피는 복잡한 생물학적 시료에서 특정 호르몬이나 비타민을 고순도로 분리하는 데 사용된다. 기체 크로마토그래피는 휘발성 지방산이나 스테로이드 분석에 적합하다. 이 기법들은 시료의 정성 분석(무엇이 있는지)과 정량 분석(얼마나 있는지)을 모두 가능하게 하여 대사 경로 연구나 질병 진단에 중요한 정보를 제공한다.

분광학은 생화학물질의 구조와 성질을 분석하는 핵심적인 연구 방법이다. 이 방법은 물질이 빛을 흡수, 방출 또는 산란할 때 나타나는 특성을 측정하여, 물질의 구성이나 농도, 분자 구조에 대한 정보를 얻는다. 생화학 연구에서는 주로 자외선-가시광선 분광법, 적외선 분광법, 핵자기 공명 분광법 등이 널리 활용된다.

자외선-가시광선 분광법은 주로 단백질이나 핵산과 같은 분자의 농도를 정량적으로 측정하는 데 사용된다. 예를 들어, DNA는 260nm 파장의 빛을 강하게 흡수하는 특성이 있어, 이 파장에서의 흡광도를 측정하면 시료 내 DNA의 농도를 쉽게 알아낼 수 있다. 적외선 분광법은 분자 내 특정 작용기, 예를 들어 아미노기나 카르보닐기 등의 진동을 감지하여 분자의 구조적 정보를 제공한다.

핵자기 공명 분광법은 가장 강력한 구조 분석 도구 중 하나로, 특히 단백질이나 작은 유기 분자의 3차원 구조를 원자 수준에서 규명하는 데 필수적이다. 이 방법은 분자 내 수소, 탄소, 인 등의 원자핵이 외부 자기장에서 보이는 공명 현상을 분석한다. 이를 통해 생화학물질이 어떻게 접혀 있고, 다른 분자와 어떻게 상호작용하는지에 대한 상세한 정보를 얻을 수 있어, 신약 개발이나 효소 메커니즘 연구에 광범위하게 응용된다.