능성어
1. 개요
1. 개요
능성어는 조기어강에 속하는 어류의 한 분류군이다. 이들은 주로 열대 및 아열대 지역의 민물과 기수역에 서식하며, 전 세계적으로 약 10과 200여 종이 알려져 있다. '능성어'라는 이름은 이들의 대표적인 특징인 지느러미 구조에서 유래한다. 대부분의 종에서 등지느러미와 항문지느러미의 앞쪽 부분이 가시처럼 변형되어 강한 가시줄기를 형성하고, 뒤쪽 부분은 부드러운 연조로 구성된다.
이들은 일반적으로 작은 체형을 가지며, 몸길이가 수 센티미터에서 20센티미터를 넘지 않는 경우가 대부분이다. 잉어나 메기와 같은 다른 흔한 민물고기들과 함께 발견되기도 하지만, 독특한 외형과 생태적 지위를 가진다. 식성은 종에 따라 다양하여, 잡식성인 종부터 육식성에 가까운 종까지 존재한다.
능성어류는 분류학적으로 오랜 기간 연구와 논의의 대상이 되어왔다. 전통적인 형태학적 특징에 기반한 분류와 최근의 분자생물학적 연구 결과가 항상 일치하지는 않아, 그 계통적 위치와 하위 분류 체계는 계속해서 재검토되고 있다. 이들의 진화적 역사와 다른 조기어류와의 관계를 이해하는 것은 어류 계통학 연구에서 중요한 주제 중 하나이다.
2. 분류학적 위치
2. 분류학적 위치
능성어는 조기어강 내에서 진골어류에 속하는 어류의 한 분류군이다. 전통적으로는 농어목 또는 주걱치목에 포함시키기도 했으나, 현재는 대부분의 분류 체계에서 독립된 능성어목으로 인정받고 있다. 이 목은 약 20여 속, 150여 종으로 구성되어 있으며, 비교적 작은 규모의 어류 분류군에 해당한다.
조기어강 내에서 능성어목의 계통적 위치는 다음과 같이 정리할 수 있다.
분류 단계 | 포함 관계 | 비고 |
|---|---|---|
강 | 경골어류의 주류를 이루는 큰 분류군 | |
아강 | 대부분의 현생 조기어류가 속함 | |
하강 | 농어, 도미, 베도라치 등 대부분의 해수어 포함 | |
상목 | 농어목, 베도라치목, 능성어목 등이 속하는 큰 그룹 | |
목 | 능성어류가 속하는 독립된 목 |
능성어목의 하위 분류는 크게 두 개의 과로 나뉜다. 능성어과는 대부분의 종을 포함하는 주된 과이며, 유럽능성어과는 지중해와 북대서양에 서식하는 소수의 종만을 포함한다. 일부 분류 체계에서는 능성어과 내에 여러 아과를 설정하기도 한다. 최근의 분자생물학적 연구는 기존의 형태학적 분류를 지지하거나 세부적으로 수정하는 결과를 보여주고 있다[1].
2.1. 조기어강 내 분류
2.1. 조기어강 내 분류
조기어강은 경골어류의 주요 분류군 중 하나로, 능성어는 이 강 내에서 진골어하강에 속하는 능성어목으로 분류된다. 능성어목은 조기어강 내에서 비교적 원시적인 특징을 유지한 그룹으로 여겨지며, 잉어목이나 메기목과 같은 다른 주요 어목들과는 뚜렷한 형태학적 차이를 보인다.
능성어의 분류학적 위치를 보다 구체적으로 나타내면 다음과 같은 계층 구조를 가진다.
전통적으로 능성어목은 단일 과인 능성어과만을 포함하는 단형 목으로 간주되어 왔다. 그러나 일부 분류 체계에서는 골설어상목 내에서 잉어목 및 메기목과 자매군 관계에 있다고 제안되기도 한다. 최근의 분자생물학적 연구는 능성어가 조기어강의 기저 분류군 중 하나일 가능성을 시사하며, 이들의 진화적 위치에 대한 논의는 지속되고 있다[2].
2.2. 하위 분류군
2.2. 하위 분류군
능성어목은 전통적으로 2개의 과로 나뉘어 왔다. 그러나 분류 체계는 연구에 따라 변동이 있으며, 일부 연구에서는 더 많은 과를 인정하기도 한다.
과명 (학명) | 대표 속 예시 | 주요 특징 |
|---|---|---|
능성어과 (Ephippidae) | 몸체가 매우 높고 측편되어 있으며, 등지느러미와 뒷지느러미의 연조가 길게 연장된다. 어린 개체는 형태와 체색이 성체와 현저히 다르다. | |
다이어클리움과 (Drepanidae) | 다이어클리움속 (*Drepane*) | 몸체는 능성어과에 비해 덜 높고, 가슴지느러미가 낫 모양으로 매우 길다. 입은 신축성이 뛰어나 아래쪽으로 튀어나올 수 있다. |
일부 최근의 분자생물학적 연구는 다이어클리움과를 능성어과 내에 포함시키는 것을 지지하기도 한다[3]. 반면, 형태학적 차이를 근거로 두 과를 명확히 구분하는 관점도 여전히 유효하다. 이 그룹의 계통 분류학적 관계는 아직 완전히 정립되었다고 보기 어렵다.
3. 형태학적 특징
3. 형태학적 특징
몸은 일반적으로 측편되어 있으며, 대부분의 종에서 체고가 높은 편이다. 등지느러미는 하나로 연결되어 있거나, 앞쪽의 가시줄과 뒤쪽의 연조부가 분리되어 있다. 가슴지느러미는 비교적 높은 위치에 있으며, 배지느러미는 가슴지느러미 아래에 위치하는 경우가 많다. 꼬리지느러미는 대체로 양엽형이다.
비늘은 대부분 둥근비늘을 가지며, 빛에 따라 변하는 은빛을 띠는 것이 특징이다. 체색은 종에 따라 다양하지만, 등쪽은 어두운 색을, 배쪽은 밝은 색을 나타내는 경우가 일반적이다. 일부 종에서는 산란기에 과도한 체색 변화를 보이기도 한다.
머리는 비교적 작고, 눈은 크며 측면에 위치한다. 입은 대체로 작고, 위를 향해 열리는 경향이 있다. 이는 수면 근처에서 먹이를 섭취하는 습성과 관련이 깊다. 아래턱은 위턱보다 돌출되어 있으며, 전상악골과 주상악골로 구성된 구개골 구조를 가진다.
3.1. 지느러미 구조
3.1. 지느러미 구조
능성어의 지느러미 구조는 이 분류군을 정의하는 핵심적인 형태학적 특징 중 하나이다. 특히 등지느러미와 뒷지느러미의 독특한 배열이 두드러진다.
대부분의 종은 두 개의 등지느러미를 가지며, 이들은 서로 분리되어 있다. 첫 번째 등지느러미는 일반적으로 가시줄기로 구성되어 있고, 두 번째 등지느러미는 연조로 이루어져 있다. 뒷지느러미 역시 하나의 가시줄기와 여러 개의 연조를 포함하는 경우가 많다. 가슴지느러미는 비교적 높은 위치에 있으며, 꼬리지느러미는 대체로 갈라져 있다. 배지느러미는 일반적으로 가슴지느러미 아래쪽, 즉 복부에 위치한다.
지느러미 가시의 수와 연조의 수는 종을 구분하는 중요한 분류학적 형질로 활용된다. 예를 들어, 등지느러미와 뒷지느러미의 가시 수, 두 번째 등지느러미의 연조 수, 뒷지느러미의 연조 수 등을 세밀히 비교한다. 일부 속에서는 지느러미 줄기의 길이나 모양이 종 특이적이다. 이러한 지느러미 구조는 유영 시의 기동성과 안정성에 기여하며, 서식 환경과 생활 방식과도 연관되어 있다.
3.2. 비늘과 체색
3.2. 비늘과 체색
능성어의 비늘은 대부분 둥근비늘(cycloid scale)로, 가장자리가 매끈하고 얇은 원형의 판 모양을 이룬다. 이 비늘은 피부에 얕게 박혀 있어 탈락하기 쉽다. 일부 종에서는 비늘이 퇴화되거나 아예 없는 경우도 있다.
체색은 종에 따라 다양하지만, 일반적으로 은백색, 은회색, 또는 황금빛을 띤 은색의 배쪽과 짙은 청록색 또는 녹갈색의 등쪽을 가진다. 이는 상층에서의 위장에 유리한 위장색이다. 몸통 측면에는 종종 은색의 세로띠가 나타나며, 이는 빛을 산란시켜 포식자로부터 몸의 윤곽을 흐리게 하는 역할을 한다.
산란기에는 일부 종에서 혼인색이 나타난다. 수컷의 지느러미 가장자리가 선명한 붉은색이나 주황색을 띠거나, 몸체에 반점이 생기는 등의 변화를 보인다. 체색 패턴은 종 동정과 분류에 중요한 형태학적 기준으로 활용된다.
3.3. 두부 및 구강 구조
3.3. 두부 및 구강 구조
능성어의 머리 부분은 비교적 작고, 주둥이는 뾰족하거나 둥근 형태를 보인다. 눈은 크며, 측면에 위치하여 시야를 넓게 확보한다. 두개골의 구조는 단단하고, 일부 종에서는 두부에 작은 가시가 존재하기도 한다.
구강 구조는 이들의 섭식 습성과 밀접한 연관이 있다. 입은 대체로 작고, 위쪽을 향해 경사져 있으며, 추상위구의 특징을 보인다. 이는 수면 근처에서 먹이를 포획하는 데 적합한 구조이다. 턱에는 작고 날카로운 이빨이 줄지어 있으며, 주로 동물성 플랑크톤이나 작은 수생 곤충을 잡아먹는다.
아가미 구조도 특징적이다. 아가미뚜껑은 잘 발달되어 있으며, 아가미살은 길고 가늘어서 물을 효율적으로 걸러낸다. 일부 종에서는 인두골에 이차적인 저작 기관이 발달하기도 한다. 이러한 두부 및 구강 구조의 특징은 조기어류의 기본적인 형태를 유지하면서도, 특정 생태적 지위에 적응한 결과로 해석된다.
4. 생태와 서식지
4. 생태와 서식지
능성어는 주로 인도태평양의 열대 및 아열대 해역에 널리 분포한다. 그 범위는 동쪽으로는 태평양의 하와이 제도와 프랑스령 폴리네시아부터, 서쪽으로는 인도양의 적도 연안과 아프리카 동해안까지 이른다. 특히 인도네시아와 필리핀, 대보초, 말레이 제도 주변 해역에서 개체수가 풍부하다.
이들은 주로 수심 1~30미터 사이의 얕은 산호초 지역을 선호한다. 해초가 무성한 모래 바닥, 라군, 암초 지대, 그리고 만 입구의 조용한 수역 등 다양한 서식 환경에 적응해 살아간다. 수온이 따뜻하고 수질이 맑은 환경을 좋아하며, 대부분의 종이 군집 생활보다는 단독 또는 소규모로 서식한다.
서식지 내에서의 생태적 지위는 주로 저서성 생활에 맞춰져 있다. 몸을 기울여 바닥 가까이에서 생활하며, 저서생물과 작은 무척추동물 등을 포식한다. 이들의 분포와 서식지 선택은 수심, 수온, 염분, 그리고 먹이 자원의 가용성에 크게 영향을 받는다.
4.1. 분포 지역
4.1. 분포 지역
능성어는 주로 인도태평양 지역의 열대 및 아열대 해역에 널리 분포한다. 서쪽으로는 홍해와 아프리카 동부 해안부터 동쪽으로 하와이 제도, 투아모투 제도까지, 북쪽으로는 일본 남부와 한국 남해안부터 남쪽으로 오스트레일리아 대보초와 뉴칼레도니아까지 발견된다[4]. 이 광범위한 분포는 해류를 타고 확산되는 부유성 알과 유생기의 특성과 관련이 있다.
주요 서식지는 수심 50미터 이내의 얕은 대륙붕 해역이며, 특히 산호초 지역과 해초가 무성한 모래 바닥을 선호한다. 인도네시아와 필리핀을 중심으로 한 동남아시아 군도 해역에서 개체수가 가장 풍부한 것으로 알려져 있다. 일부 개체군은 페르시아만과 같은 반폐쇄성 해역에도 적응하여 서식한다.
분포 범위 내에서도 지역에 따라 아종 분화가 일어나거나 체색 패턴에 약간의 차이가 관찰된다. 예를 들어, 서인도양 개체군과 중부 태평양 개체군 간에는 지느러미 줄무늬의 배열에 미세한 변이가 보고된 바 있다. 수온이 낮은 고위도 지역으로의 확산은 제한적이며, 이는 능성어가 비교적 높은 수온을 요구하는 열대성 어류임을 시사한다.
4.2. 서식 환경
4.2. 서식 환경
능성어는 주로 열대 및 아열대 지역의 얕은 해역에 서식한다. 대부분의 종은 수심 50미터 이내의 연안, 특히 산호초 지역이나 해초밭, 암초 지대를 선호한다. 일부 종은 기수역이나 맹그로브 숲이 발달한 해안 습지에도 출현한다. 이들은 수심이 얕고 수온이 비교적 높으며, 구조물이 복잡하여 은신처와 먹이 공급원이 풍부한 환경에 의존하는 경향이 있다.
서식 환경에 따른 적응 양상은 다양하다. 산호초에 사는 종들은 체색이 화려하고 몸이 측편되어 좁은 틈새로 이동하기에 유리한 형태를 보인다. 반면, 해초밭에 서식하는 종들은 몸색이 녹색이나 갈색 계열로 위장되어 있으며, 몸체가 길쭉한 경우가 많다. 이들은 주간에는 해초나 암초 사이에 숨어 있다가 야간에 활동하는 습성을 보이기도 한다.
수질 조건에 대한 요구도는 종에 따라 다르지만, 일반적으로 맑고 깨끗한 물을 선호한다. 수온은 20°C 이상의 따뜻한 환경에서 주로 발견되며, 계절에 따라 서식 수심을 바꾸는 이동을 보이는 종도 있다. 일부 능성어는 조수 간만의 영향을 크게 받는 조간대 지역에도 적응하여 살아간다.
5. 생활사와 생식
5. 생활사와 생식
능성어는 계절에 따라 산란 활동을 하는 난생어류이다. 대부분의 종은 봄에서 여름 사이에 산란하며, 수온과 일조 시간이 중요한 유발 요인으로 작용한다. 일부 종은 특정한 조간대나 해초밭을 산란장으로 선택하는 경향을 보인다.
산란은 일반적으로 암컷이 해저 모래나 자갈 속, 또는 해초 잎 사이에 알을 부착시키는 방식으로 이루어진다. 알은 점액질로 덮여 있어 외부 충격으로부터 보호받는다. 한 번의 산란으로 수백에서 수천 개의 알을 낳으며, 알의 크기는 종에 따라 다양하다.
발생 단계 | 주요 특징 | 지속 시간 (대략적) |
|---|---|---|
수정란 | 투명한 난막, 난황 함유 | 수시간 ~ 1일 |
전기 자어 | 난황 흡수, 부화 직후 | 부화 후 수일 |
후기 자어 | 지느러미 막 형성 시작, 자유 유영 | 수주 |
치어 | 성체와 유사한 형태 완성, 군집 생활 | 수개월 |
부화한 자어는 초기에 난황낭에 의존하다가, 빠르게 플랑크톤을 포식하는 생활로 전환한다. 성장에 따라 점차 저서 생활로 옮겨가며, 치어 단계에서는 종종 무리를 지어 생활한다. 성체가 되기까지 걸리는 시간은 종과 환경에 따라 차이가 크다.
5.1. 산란 습성
5.1. 산란 습성
대부분의 능성어 종은 해양어류로, 산란은 주로 수온이 상승하는 봄과 여름철에 이루어진다. 일부 종은 특정한 산란장으로의 회유를 보이기도 한다. 산란 방식은 대체로 난생이며, 암컷이 수정된 알을 물속에 방출하는 산란을 한다.
산란된 알은 부유성 난의 특성을 가지는 경우가 많아, 해류를 타고 널리 분산된다. 이는 능성어의 광범위한 지리적 분포에 기여하는 요인 중 하나이다. 알에서 부화한 자어는 플랑크톤 생활을 하며 성장한다.
일부 연안성 종이나 담수어류로 분류되는 종의 경우, 산란 습성에 차이를 보일 수 있다. 예를 들어, 민물 환경에 서식하는 일부 종은 수초나 암석 등에 알을 부착시키는 습성을 나타낸다.
5.2. 발생 단계
5.2. 발생 단계
능성어의 알은 점액성 알집에 싸여 바닥에 부착되거나, 일부 종은 부유성 알을 낳는다. 부화한 자어는 난황을 가지고 있으며, 초기에는 플랑크톤 생활을 한다. 성장함에 따라 측선이 발달하고 체형이 성어와 유사해지며, 점차 저서 생활로 전환한다.
발생 단계는 크게 난황 자어기, 후기 자어기, 치어기로 구분된다. 각 단계별 주요 특징은 다음과 같다.
발생 단계 | 주요 특징 | 기간 (대략적) |
|---|---|---|
난황 자어기 | 난황낭 존재, 소화관 미발달, 수동적 부유 | 부화 후 수일 |
후기 자어기 | 난황 흡수 완료, 구기 형성, 능동적 섭식 시작 | 수일~수주 |
치어기 | 성어와 유사한 체형 완성, 비늘 형성 시작, 저서 생활로의 전환 | 수주~수개월 |
치어기 이후 미성어 단계를 거쳐 성적으로 성숙한 성어가 된다. 성장 속도와 성숙 연령은 종과 서식 환경에 따라 차이가 크다. 일부 심해성 능성어의 경우, 성장이 매우 느리고 장수하는 것으로 알려져 있다[5].
6. 진화적 중요성
6. 진화적 중요성
능성어는 조기어강 내에서도 매우 기초적인 계통을 대표하는 어류로서, 진화 연구에서 중요한 위치를 차지한다. 이들은 경골어류와 연골어류의 분화 이후, 경골어류 내에서 초기에 갈라진 계통으로 여겨진다. 따라서 능성어의 형태적, 생리적 특징은 고대 경골어류의 원시적 형태를 이해하는 데 중요한 단서를 제공한다.
특히, 능성어의 지느러미 구조는 진화적 중간 형태를 보여준다. 가슴지느러미와 배지느러미의 근육 기저가 잘 발달되어 있어, 이들이 육지 동물의 사지로 진화할 가능성을 가진 초기 구조를 유지하고 있다고 해석된다[6]. 또한, 폐와 유사한 기능을 하는 부레를 가지고 있어, 공기 호흡이 가능한 어류의 초기 적응 형태를 보여준다.
분자생물학적 연구에서도 능성어는 중요한 역할을 한다. 유전체 분석을 통해 능성어는 다른 대부분의 경골어류보다 폐어 및 육기어류와 더 가까운 계통 관계를 가진 것으로 확인되었다. 이는 경골어류 진화 초기에 일어난 주요 분기 사건을 규명하는 데 결정적인 증거가 되었다. 결국, 능성어는 살아있는 화석으로 불리며, 어류에서 육상 척추동물로의 진화 과도기를 연구하는 살아있는 창(window) 역할을 한다.
7. 연구 현황
7. 연구 현황
능성어의 분류학적 위치는 오랜 기간 논쟁의 대상이었다. 전통적으로는 조기어강 내에서 잉어목이나 잉어류와 가까운 관계로 여겨졌으나, 독특한 형태적 특징들로 인해 별도의 목(目)으로 분류되기도 했다. 주요 논쟁점은 능성어가 진골어류의 기저 분류군인지, 아니면 더 진화된 골설어류와 같은 그룹 내에 위치하는지였다. 일부 연구자들은 능성어의 특이한 지느러미 구조와 두개골 형태가 매우 원시적이라 주장한 반면, 다른 이들은 이 특징들이 수렴진화의 결과일 수 있다고 보았다.
분자생물학적 연구가 활성화되면서 능성어의 계통적 위치에 대한 새로운 증거들이 제시되었다. 미토콘드리아 DNA와 핵 DNA 서열 분석을 바탕으로 한 계통발생학 연구들은 능성어가 잉어목 및 메기목과 함께 오스타리오피시 계통군 내에 속한다는 강력한 지지를 보여주었다. 특히, 단일계통군 분석 결과는 능성어가 잉어류와 자매군을 이룰 가능성을 시사한다. 아래 표는 주요 분자 계통 연구에서 제안된 능성어의 계통적 위치를 요약한 것이다.
연구 (발표년도) | 사용된 유전자 마커 | 제안된 계통적 위치 |
|---|---|---|
Chen et al. (2003) | 미토콘드리아 12S, 16S rRNA | 오스타리오피시 내 기저 분지 |
Saitoh et al. (2006) | 핵 라이보솜 DNA | |
Betancur-R et al. (2017) | 1,000개 이상의 외부 형질 유전자 |
현재까지의 연구는 능성어가 조기어강 내에서 독특한 진화적 역사를 가진 분류군임을 확인시켜 주지만, 그 정확한 자매 분류군과 분기 시점에 대해서는 여전히 추가적인 연구가 필요하다. 최근의 유전체학 연구는 더 많은 유전 정보를 제공하여 이 논쟁에 해결책을 제시할 가능성이 있다.
7.1. 분류학적 논쟁
7.1. 분류학적 논쟁
능성어의 분류학적 위치는 오랜 기간 동안 논쟁의 대상이었다. 전통적으로 능성어는 조기어강 내에서 골설어목에 속하는 것으로 간주되었다. 이는 주로 지느러미 구조, 특히 등지느러미와 뒷지느러미의 위치와 형태, 그리고 두부의 골격적 특징에 기반한 형태학적 분석 결과였다. 그러나 일부 연구자들은 능성어가 골설어목의 다른 어류들과 뚜렷한 차이를 보인다고 지적하며, 별도의 목(目)으로 분류해야 한다는 주장을 제기하기도 했다.
분자생물학적 연구가 발전하면서 이 논쟁은 새로운 국면을 맞았다. 미토콘드리아 DNA와 핵 DNA 서열을 이용한 계통분석 결과는 기존의 형태학적 분류와 일치하지 않는 경우가 빈번하게 나타났다. 일부 연구는 능성어가 골설어목 내에서도 특정 계통군과 밀접한 관련이 있다고 제시하는 반면, 다른 연구는 전혀 예상치 못한 위치에 능성어를 배치하기도 했다. 이러한 불일치는 수렴진화나 형태소의 빠른 분화와 같은 진화적 과정이 형태적 특징을 왜곡했을 가능성을 시사한다.
현재의 주요 논쟁점은 능성어를 구성하는 속(屬)들의 단계통성 여부이다. 일부 학자들은 능성어과가 단계통군이 아니며, 여러 독립적인 계통이 유사한 형태로 진화했을 수 있다고 주장한다. 이는 다양한 지리적 분포와 미세한 형태적 변이를 근거로 한다. 반면, 최근의 포괄적인 분자계통연구는 전통적인 능성어 분류군의 단계통성을 지지하는 결과를 내놓기도 한다. 이 논쟁은 표본 채집의 어려움과 이용 가능한 유전자 마커의 한계로 인해 아직 완전히 해결되지 않았다.
주요 논쟁점 | 전통적 견해 (형태학) | 대안적 견해/논란 |
|---|---|---|
목 수준 분류 | 골설어목 내 속함 | 별도의 목(目) 필요성 제기 |
과의 단계통성 | 단일 계통으로 가정 | 다계통군일 가능성 제기 |
근연 관계 | 특정 골설어류와 가까움 | 분자 데이터에 따른 예상외 계통 위치 |
이러한 분류학적 불확실성은 능성어의 생물다양성 평가와 보전 전략 수립에 직접적인 영향을 미친다. 명확한 계통 관계가 확립되지 않으면, 각 종의 진화적 독특성을 평가하고 보호 우선순위를 결정하는 데 어려움이 따르기 때문이다. 따라서 향후 연구는 형태학적 데이터와 다양한 유전자 영역에서의 분자 데이터를 통합한 총체적 분석에 초점을 맞출 필요가 있다.
7.2. 분자생물학적 연구
7.2. 분자생물학적 연구
능성어의 분자생물학적 연구는 DNA 염기서열 분석과 계통유전학적 방법을 중심으로 진행되어 왔다. 이 연구들은 전통적인 형태학적 분류의 한계를 보완하고, 조기어강 내에서 능성어의 정확한 계통적 위치를 규명하는 데 중요한 역할을 한다. 특히 미토콘드리아 DNA와 핵 DNA의 특정 유전자 부위를 분석하여, 능성어가 진골어류와 연골어류 사이의 진화적 관계를 이해하는 데 중요한 정보를 제공한다.
주요 연구는 사이토크롬 b, 16S rRNA, COI와 같은 미토콘드리아 유전자와 RAG1, Rhodopsin 같은 핵 유전자의 염기서열을 비교 분석하는 방식으로 이루어진다. 이러한 연구 결과는 능성어가 조기어강 내에서 비교적 고유한 계통군을 형성하며, 다른 원구류나 경골어류와는 뚜렷이 구별된다는 점을 지지한다. 또한, 분자 시계 분석을 통해 능성어 계통의 분기 시점을 추정하는 연구도 수행되었다.
분자생물학적 접근은 능성어의 다양한 하위 분류군 간의 관계를 명확히 하는 데에도 기여한다. 예를 들어, 전 세계에 분포하는 여러 능성어 종들 간의 유전적 거리를 측정함으로써, 지리적 격리와 종 분화 과정을 추론할 수 있다. 이는 형태적 변이가 적은 능성어의 분류 체계를 정립하는 데 필수적인 정보를 제공한다. 최근에는 전장 유전체 분석과 같은 차세대 염기서열 분석 기술이 도입되어, 능성어의 진화 유전체학 연구로 확장되고 있다.
