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김민서는 2023시즌을 앞두고 K3리그의 포천시민축구단에 입단하며 프로 커리어를 시작했다. 같은 해 팀의 공격수로 2경기에 출전했으며, 2024시즌에도 잔류했다. 2024시즌에는 총 13경기에 나서 1골을 기록하는 활약을 펼쳤다. 그러나 시즌 종료 후 자유계약 선수로 풀려나게 되었고, 이후 서울 중랑 축구단으로 이적하게 된다. 포천시민축구단에서의 두 시즌은 그가 프로 무대에 첫발을 내딛는 기간이었다.
2025 시즌을 앞두고 서울 중랑 축구단에 입단하였다. 이로써 김민서는 포천시민축구단에서의 활동을 마치고 K4리그에 참가하는 새로운 팀으로 이적하게 되었다. 서울 중랑 축구단에서 그는 등번호 23번을 배정받았다.
서울 중랑 축구단은 서울특별시 중랑구를 연고지로 하는 세미프로 축구단으로, 김민서의 합류는 팀의 공격 라인 강화를 위한 움직임으로 평가된다. 같은 시즌 팀에는 윤태웅, 박관우, 고준영 등 다수의 선수들이 함께했다.
이적 이후 그의 공식전 출전 기록과 득점, 도움 등의 세부 성적은 아직 공개되지 않았다. 향후 K4리그에서의 활약을 통해 그의 경쟁력과 발전 가능성을 가늠할 수 있을 것으로 보인다.

김민서는 포천시민축구단 시절부터 팬들 사이에서 '겜멘세'라는 별명으로 불렸다. 이 별명은 그의 이름과 인터넷 문화에서 유래한 것으로 보인다. 그는 평소 스포티지 차량을 타고 다니는 것으로 알려져 있다.
서울 중랑 축구단으로 이적한 2025 시즌에는 등번호 23번을 배정받았다. 이는 포천시민축구단에서도 유지했던 등번호이다. 그의 유소년 시절은 대동세무고등학교에서 보냈으며, 공격수로서의 기량을 키웠다.
현재 서울 중랑 축구단의 스쿼드에는 김선준, 이동현, 김강연 등 다양한 선수들이 포진해 있으며, 김민서는 이 팀에서 새로운 도전을 이어가고 있다. 그의 앞으로의 활약이 기대되는 부분이다.